RESSONÀNCIA MAGNÈTICA NUCLEAR
Responsable científic: Yolanda Pérez
La funció principal del Servei de RMN és proporcionar recursos i el personal necessari per a l’adquisició d’espectres RMN dels investigadors IQAC. Els seus serveis també estan disponibles per investigadors d’universitats o centres públics i empreses privades.
Yolanda Pérez
Responsable científic
yolanda.perez@iqac.csic.es
El servei té experiència en estudis de la RMN en dissolució:
- Anàlisi de molècules petites,
- Caracterització estructural.
- Anàlisi de mescles/difusió RMN.
- Anàlisi quantitativa.
- Dinàmica RMN.
- Estudis de proteïnes i pèptids
- Estudis estructurals
- Experiments de doble/triple ressonància per a pèptids / proteïnes (< 20 KDa).
- Caracterització de les interaccions proteïna-molècula petita.
- Estudis estructurals
- Espectres de RMN de cèl·lules (“in vitro”), extractes de cèl·lules i metabolòmica per RMN.
Anàlisis de rutina
Typical experiments, which are offered as examples of routine analysis, include:
- Experiments 1D de 1H NMR, incloent-hi processament bàsic de les dades.
- Experiments 1D de 31P NMR, 13C NMR i 19F NMR.
- Experiments 2D 1H –1H i 1H –13C de rutina, com COSY, NOESY, HSQC, HMBC,…
Estudis avançats
- Elucidació estructural i control de qualitat en química sintètica mitjançant RMN 1D/2D en solució.
- Implementació de nous mètodes de RMN.
- Cribatge de fàrmacs per RMN (“drug screening”) i estudis estructura-activitat (SAR).
- Espectres de cèl·lules (“in vitro”), extractes de cèl·lules i Metabolòmica per RMN.
- Experiments de Difusió i DOSY.
- Adquisició d’experiments de Doble/Triple de ressonància per pèptids/proteïnes (<20 KDa).
Accés al servei
- El personal ofereix serveis d’assessorament científic i tècnic en RMN (processament, interpretació de dades, disseny d’experiments).
- També col·laborem en projectes de recerca, participant a nivell científic a l’aplicació de metodologies avançades de RMN.
Equips i Recursos Disponibles
Bruker Ascend 400 MHz (9.4 T) amb sonda iProbe a temperatura ambient i carregador SampleXPress
Aquest és l’instrument per a l’adquisició automàtica d’experiments de RMN homo i heteronuclears. L’espectròmetre compta amb una consola AVANCE NEO, una sonda iProbe a temperatura ambient, una unitat de control de temperatura BCU-I i un canviador automàtic de mostres SampleXPress, amb capacitat per a 60 tubs de RMN. L’espectròmetre utilitza el software TopSpin 4.1 en un equip Linux.
Aquest equip va ser adquirit amb un ajut FEDER EQC2018-004579-P.
Bruker AVANCEIIIHD 500 MHz (11.7440 T) amb Criosonda TCI i carregador SampleXPressLite.
Aquest sistema és el més adequat per l’estudi de mostres més exigents: metabolòmica, biomolècules (proteïnes < 20 KDa, pèptids i àcids nucleics) i 1H i 13C de rutina de petites molècules a baixes concentracions.
Aquest equipament va ser adquirit mitjançant un ajut del MINECO (MINECO-FEDER CSIC13-4E-2076).
El Servei de utilitza una gran varietat d’aplicacions de programari pel processament de dades i preparació d’informes: Topspin, MestRENova, MSpin, CCPN, Bruker Amix/BBIOREFCODE, ChemOffice,…
Publications
- Pseudopeptidic host adaptation in peptide recognition unveiled by ion mobility mass spectrometry-
Lucia Tapia, Yolanda Pérez, Jordi Solà, Santiago V. Luis, Ignacio Alfonso and Cristian Vicent
Analyst, 2022,147, 5546-5556
- Dynamic Combinatorial Optimization of In Vitro and In Vivo Heparin Antidotes-
Daniel Carbajo, Yolanda Pérez, Marta Guerra-Rebollo, Eva Prats, Jordi Bujons, and Ignacio Alfonso
J. Med. Chem. 2022, 65, 4865−4877
- pH‐Dependent Chloride Transport by Pseudopeptidic Cages for the Selective Killing of Cancer Cells in Acidic Microenvironments-
Tapia, L., Pérez, Y., Bolte, M., Casas, J., Solà, J., Quesada, R., Alfonso, I.
Angewandte Chemie - International Edition, 58 (36), pp. 12465-12468. 2019
- Compression of multidimensional NMR spectra allows a faster and more accurate analysis of complex samples-
Puig-Castellvi, F., Perez, Y., Piña, B. Tauler, R. and Alfonso, I.
Chem Commun. 54 (25), 3090-3093, 2018.
- Reversible Self-Assembly of Water-Soluble Gold (I) Complexes-
Aguiló, E., Moro, A..J., Gavara, R., Alfonso, I., Perez, Y., Zaccaria, F., Rodriguez, L.
Inorg Chem. 57(3), 1017-1028, 2018.
- Structural study of a new HIV‐1 entry inhibitor and interaction with the HIV‐1 fusion peptide in dodecylphosphocholine micelles-
Perez, Y., Gomara, M.J., Yuste, E., Gomez-Gutierrez, P., Perez, J.J, Haro, I. Chemistry-A European J. 23(48), 11703-11713, 2017.
- The Unique Domain Forms a Fuzzy Intramolecular Complex in Src Family Kinases-
Arbesu, M., Maffei, M., Cordeiro, T.N., Teixeira, J.M.C., Perez, Y., Bernado, P., Roche, S. , Pons, M. Structure 15, 630-640, 2017.
- Cationic peptides and Peptidomimetics bind glycosaminoglycans as potential Sema3A pathway inhibitors-
Corredor, M., Bonet, R., Moure, A., Domingo, C., Bujons, J., Alfonso, I., Perez, Y. and Messeguer, A. Biophys J. 110 (6), 1291-1303, 2016.
- Supramolecular protection from the enzymatic tyrosine phosphorylation in a polypeptide-
Faggi, E., Perez, Y., Luis, S.V. and Alfonso, I. Chem Commun. 52 (52), 8142-8145, 2016.
- Galacto configured N-aminoaziridines: a new type of irreversible inhibitor of β-galactosidases-
Alcaide, A., Trapero, A., Perez, Y. and Llebaria A.
Org & biomolec chem 13 (20), 5690-5697, 2015. - Conjugation of cell-penetrating peptides with poly (lactic-co-glycolic acid)-polyethylene glycol nanoparticles improves ocular drug delivery-
Vasconcelos, A., Vega, E., Perez, Y., Gomara, M.J., Garcia, M.L. and Haro, I. Int J Nanomedicine 10, 609-631, 2015.
- A cyclic GB virus C derived peptide with anti-HIV-1 activity targets the fusion peptide of HIV-1-
Galatola, R., Vasconcelos, A., Perez, Y., Cruz, A., Pujol, M., Alsina, M.A., Gomara, M.J. and Haro, I.
Eur J Med Chem. 2014 86, 589-604.
- Lipid binding by the Unique and SH3 domains of c-Src suggests a new regulatory mechanism-
Perez, Y., Maffei, M., Igea, A., Amata, I., Gairí, M., Nebreda, A.R., Bernadó, P. and Pons, M. Scientific reports 3, 1295, 2013.
- Lipid binding by disordered proteins-
Perez, Y., Maffei, M., Amata, I., Arbesu, M. and Pons, M. Protocol Exchange 10, 2013.
