Archivos de Grupo de investigación

Berta Bori

Soy investigadora predoctoral en el IQAC-CSIC, donde realizo mi doctorado en bioquímica computacional dentro del grupo de Química Computacional y Teórica. Con el apoyo de una beca FPU, mi investigación se centra en el diseño de nanocuerpos para la detección y unión de moléculas pequeñas, en colaboración con el grupo Nb4D.

Cuento con un grado en Química y un máster en Modelización Computacional y Química Teórica, ambos por la Universitat de Barcelona. A lo largo de mis estudios desarrollé una fuerte pasión por la programación y los métodos computacionales. Actualmente, mi principal interés es mejorar y desarrollar técnicas computacionales para el diseño de nanocuerpos, con el objetivo de ampliar sus aplicaciones en diversos campos.

Entre otras herramientas, utilizo técnicas de deep learning para el diseño, la predicción estructural y el docking, además de simulaciones de dinámica molecular. También estoy ampliando mi formación en machine learning e inteligencia artificial para potenciar mi investigación.

Albert Ortega

Albert Ortega Bartolomé es estudiante de doctorado en el Instituto de Química Avanzada de Cataluña (IQAC–CSIC), donde su investigación se sitúa en la intersección de la bioinformática, la química computacional y el control sostenible de plagas.

Su trabajo doctoral se centra en la aplicación de técnicas de aprendizaje profundo (deep learning) y simulación molecular para diseñar nuevos compuestos que modulen el comportamiento de los insectos, con especial énfasis en las interacciones ligando-receptor de olor en las langostas. Su investigación emplea herramientas computacionales avanzadas, incluidas simulaciones de dinámica molecular, modelado basado en AlphaFold3 y métodos de perturbación de energía libre (FEP), para predecir la afinidad del ligando y la respuesta del receptor.

Ramon Crehuet Simón

Formado como químico, con una licenciatura y un doctorado por la University of Barcelona. Sus líneas de investigación se centran en la dinámica y los mecanismos biomoleculares, dentro del ámbito de la bioquímica y biofísica computacional. Estudia proteínas intrínsecamente desordenadas y su separación de fases líquido-líquido, un fenómeno biológico descubierto recientemente con implicaciones en la transcripción, la agregación de proteínas, entre otros. Se centra en proteínas implicadas en el cáncer de próstata y en el trastorno del espectro autista.

Trabaja en la importancia de la dinámica en la catálisis enzimática y el diseño de proteínas. También se enfoca en la maquinaria de replicación del ADN y en receptores olfativos de insectos, entre otros sistemas. Sus resultados han mostrado la importancia de los movimientos conformacionales y el papel de conformaciones seleccionadas. En su investigación utiliza métodos computacionales que van desde la química cuántica hasta técnicas de aprendizaje profundo. Desarrolla métodos para integrar resultados de simulación con datos experimentales. Tiene un compromiso firme con la ciencia abierta.

Eloy Ramos Cordoba

Eloy Ramos Cordoba obtuvo su doctorado en la University of Girona en 2014. Su investigación doctoral se centró en el desarrollo de nuevas herramientas y software de enlace químico para abordar problemas químicos complejos. Tras completar el doctorado, realizó investigación postdoctoral en el Donostia International Physics Center (DIPC), especializándose en correlación electrónica y propiedades moleculares. Posteriormente, obtuvo una beca Marie Skłodowska-Curie, que le permitió continuar su investigación postdoctoral en la University of California, Berkeley, donde desarrolló métodos computacionales avanzados para caracterizar estados excitados de transferencia de carga.

A su regreso a España, se incorporó a la University of the Basque Country (UPV/EHU) como investigador Juan de la Cierva y más tarde como investigador Ikerbasque, continuando su investigación en teoría de la estructura electrónica y enlace químico. Actualmente, es científico titular en el IQAC-CSIC, donde lidera proyectos que investigan de manera sistemática las limitaciones y puntos de fallo de los métodos cuánticos de estructura electrónica, incluyendo tanto los métodos basados en funciones de onda como las aproximaciones de la teoría del funcional de la densidad. También desarrolla nuevas herramientas interpretativas del enlace químico para conectar los cálculos de mecánica cuántica con los conceptos químicos tradicionales.

Ramon Guixa Gonzalez

Ramon Guixà-González es científico titular en el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) en Barcelona y especialista en bioquímica computacional. Su investigación integra simulaciones multiescala de dinámica molecular, tanto clásicas como de muestreo mejorado, para investigar las complejas interacciones entre lípidos y proteínas de membrana. Uno de sus principales objetivos es comprender cómo los entornos lipídicos modulan la estructura y función de proteínas de señalización incrustadas en la membrana, especialmente los receptores acoplados a proteína G (GPCRs).

Obtuvo su doctorado en Biomedicina en 2015 en la Pompeu Fabra University (Barcelona), con estancias de investigación en los grupos de la Prof. Marta Filizola (Mount Sinai Hospital, NY, EE. UU.) y del Prof. Ilpo Vattulainen (Finlandia). Realizó investigación postdoctoral en la Charité – Universitätsmedizin (Berlín) y fue investigador postdoctoral sénior en el Paul Scherrer Institute (PSI) y el Swiss Institute of Bioinformatics (SIB). Su trabajo ha utilizado simulaciones de dinámica molecular para: (a) dilucidar los mecanismos moleculares de activación de los GPCRs, (b) estudiar cómo las membranas regulan la función de los receptores, y (c) desarrollar herramientas computacionales para apoyar la investigación interdisciplinaria.

Ha realizado contribuciones significativas a la investigación en GPCRs y biofísica de membranas. Actualmente, explora cómo los ácidos grasos poliinsaturados modelan las propiedades y la señalización de las membranas neuronales, con implicaciones para la neurociencia, la farmacología y la biofísica de membranas.

Sergi Vela Llausi

Soy un químico computacional con intereses de investigación en química cuántica, inteligencia artificial y desarrollo de software. Obtuve mi doctorado en 2014 en el Departamento de Química Física de la University of Barcelona (UB), bajo la supervisión del Prof. Juan J. Novoa y la Dra. Mercè Deumal. Después de eso, me trasladé a Estrasburgo, donde pasé tres años y medio en el Laboratoire de Chimie Quantique. Posteriormente, obtuve una beca Marie Skłodowska-Curie para incorporarme al Laboratory of Computational Molecular Design (LCMD) de la EPFL en Lausana, donde trabajé durante cuatro años.

Francesco Colizzi

Francesco Colizzi obtuvo su licenciatura en Química y Tecnologías Farmacéuticas en la Universidad de Bolonia (UniBo), realizando su tesis de máster en modelización molecular en ETH Zúrich. Obtuvo su doctorado en Ciencias Farmacéuticas por la UniBo (2009), con una investigación en química medicinal computacional que incluyó trabajo en UCSF sobre la automatización de cribados de acoplamiento molecular (DockBlaster).

Como investigador posdoctoral en SISSA, investigó la biofísica del ARN y desarrolló procedimientos computacionales para el descubrimiento de fármacos antibacterianos basados en ARN, con el apoyo de una financiación independiente y una colaboración con la Université de Sherbrooke. Tras una estancia sabática en Quebec (Canadá), se incorporó a IRB Barcelona como investigador Marie Skłodowska-Curie, donde contribuyó a estudios interdisciplinarios en química computacional y biofísica, y desarrolló enfoques de muestreo mejorado para acelerar el descubrimiento de fármacos basado en fragmentos.

Como investigador Ramón y Cajal en el Instituto de Ciencias del Mar (ICM-CSIC), fundó el Molecular Ocean Lab (https://molecularocean.csic.es/), integrando simulaciones moleculares, inteligencia artificial y ciencias marinas, con un enfoque en la contaminación por plásticos, el descubrimiento de fármacos y la ecología molecular. En 2022 obtuvo una plaza permanente en el CSIC y, desde 2024, continúa su investigación en el IQAC-CSIC.

Francesco disfruta de la docencia y la mentoría de estudiantes de múltiples disciplinas, y participa activamente en actividades de divulgación científica con centros educativos, además de organizar eventos educativos y de ciencia abierta en Barcelona.