Jordi Bujons se doctoró en Química Orgánica por la Universidad de Barcelona en 1994. Posteriormente se trasladó a la Universidad de British Columbia (Vancouver, Canadá), donde realizó una estancia postdoctoral de tres años en el grupo del Prof. A. G. Mauk, trabajando en la generación y caracterización de mutantes de la enzima citocromo c peroxidasa.

En 1998 regresó al Instituto de Química Avanzada de Cataluña, donde se consolidó como Científico Titular del CSIC en 2001, incorporándose posteriormente al grupo de Biotransformaciones y Compuestos Bioactivos (2006).

Su investigación se centra en el diseño computacional y el estudio mecanístico de enzimas como biocatalizadores en síntesis orgánica, con especial énfasis en la formación estereoselectiva de enlaces C–X. Este trabajo ha permitido la optimización racional de los centros activos de diferentes enzimas, especialmente aldolasas, con el objetivo de ampliar el alcance de sustratos, así como mejorar la eficiencia catalítica y la estereoselectividad.

Gracias a su experiencia en modelado molecular, también ha contribuido a una amplia variedad de proyectos en química biológica y medicinal, que incluyen el diseño de nuevos reguladores de la apoptosis, el estudio de moduladores del receptor GABAA_AA, el modelado de sistemas supramoleculares y el desarrollo de moléculas PROTAC dirigidas a proteínas de interés.