BIOLOGIA QUÍMICA
Jefe de grupo: Gemma Triola
El estudio de procesos biológicos mediante el uso de herramientas químicas es el área central de la Biología Química. En las últimas dos décadas se han producido grandes avances en el campo de la Biología gracias a la aplicación de estrategias químicas basadas en la síntesis de moléculas con capacidad para modular la actividad enzimática o bloquear interacciones proteína-proteína, el diseño de nuevas sondas fluorescentes, el establecimiento de métodos de proteómica que permiten la identificación de nuevas dianas celulares y el desarrollo de técnicas para la síntesis y modificación de proteínas.
Nuestro objetivo principal en el campo de la Biología Química es el desarrollo de herramientas químicas que puedan contribuir al estudio y caracterización de enfermedades y a mejorar nuestro conocimiento de procesos biológicos relevantes, con especial interés en el estudio de la autofagia, rutas de señalización celular como Sonic Hedgehog y K-ras, interacciones lípido-proteína y la regulación de la transcripción mediante el diseño de factores de transcripción artificiales. Como resultado, nuestros intereses científicos se reparten entre la química orgánica, la bioquímica, la biofísica y la química médica.
Las principales líneas de investigación del grupo se centran fundamentalmente en:
- Diseño y síntesis de moléculas como herramientas para la investigación o modulación de procesos celulares.
- Desarrollo de herramientas químicas para regular y modular la autofagia incluyendo moléculas pequeñas, péptidos y derivados de lípidos.
- Establecimiento de nuevos métodos para la síntesis y modificación de péptidos y proteínas.
- Caracterización de interacciones lípido-proteína, proteína-ADN/ARN y proteína-proteína.
Personal científico
Gemma Triola
Científico Titular
gemma.triola@iqac.csic.es
Juan Bautista Blanco
Científico Titular
juanbautista.blanco@iqac.csic.es
Personal de laboratorio
Carla Busquets
Investigador predoctoral
carla.busquets@iqac.csic.es
Iván Sánchez
Investigador predoctoral
ivan.sanchez@iqac.csic.es
- Dinuclear silver and gold bisNHC complexes as drug candidates for cancer therapy
Mireia Quintana, Alba Rodriguez-Rius, Alba Vellé, Sonia Vives, Pablo J. Sanz Miguel, Gemma Triola
Bioorganic & Medicinal Chemistry, Volume 67, 1, August 2022
- Dinuclear silver and gold bisNHC complexes as drug candidates for cancer therapy
Quintana, M., Rodriguez-Rius, A., Vellé, A., Vives, S., Sanz Miguel, P.J., Triola, G.
Bioorganic and Medicinal Chemistry, 67, art. no. 116814, 2022
- On the Utility of Chemical Strategies to Improve Peptide Gut Stability
Kremsmayr, T., Aljnabi, A., Blanco-Canosa, J.B., Tran, H.N.T., Emidio, N.B., Muttenthaler, M.
Journal of Medicinal Chemistry, 2022
- Polymeric Composite Dressings Containing Calcium-Releasing Nanoparticles Accelerate Wound Healing in Diabetic Mice
Perez-Amodio, S., Rubio, N., Vila, O.F., Navarro-Requena, C., Castaño, O., Sanchez-Ferrero, A., Marti-Munoz, J., Alsina-Giber, M., Blanco, J., Engel, E.
Advances in Wound Care, 10 (6), pp. 301-316. 2021
- Palmitoylation as a Key Regulator of Ras Localization and Function
Busquets-Hernández, C., Triola, G.
Frontiers in Molecular Biosciences, 8, art. no. 659861, . 2021
- Native Chemical Ligation via N-Acylurea Thioester Surrogates Obtained by Fmoc Solid-Phase Peptide Synthesis
Palà-Pujadas, J., Blanco-Canosa, J.B
Methods in Molecular Biology, 2133, pp. 141-161. 2020
- A hydroxylamine probe for profiling S-acylated fatty acids on proteins
Schulte-Zweckel, J., Dwivedi, M., Brockmeyer, A., Janning, P., Winter, R., Triola, G.
Chemical Communications, 55 (75), pp. 11183-11186. 2019
- Identification of benzo[cd]indol-2(1H)-ones as novel Atg4B inhibitors via a structure-based virtual screening and a novel AlphaScreen assay
Quintana, M., Bilbao, A., Comas-Barceló, J., Bujons, J., Triola, G.
European Journal of Medicinal Chemistry, 178, pp. 648-666. 2019
- Activity-Based Imaging of Acid Ceramidase in Living Cells
Yadira F. Ordóñez, José Luís Abad, Mazen Aseer, Josefina Casas, Virginie Garcia, Mireia Casasampere, Edward H. Schuchman, Thierry Levade, Antonio Delgado, Gemma Triola and Gemma Fabrias
J. Am. Chem. Soc., 2019
- Peptide Ligations by Using Aryloxycarbonyl‐o‐methylaminoanilides: Chemical Synthesis of Palmitoylated Sonic Hedgehog
Judith Palà‐Pujadas, Prof. Dr. Fernando Albericio, Dr. Juan B. Blanco‐Canosa
Angew. Chem. 2018, 130, 1 – 7
- A biochemical and genetic discovery pipeline identifies PLCδ4b as a nonreceptor activator of heterotrimeric G-proteins
Maziarz, M., Broselid, S., DiGiacomo, V., Park, J.-C., Luebbers, A., Garcia-Navarrete, L., Blanco-Canosa, J.B., Baillie, G.S., Garcia-Marcos, M.
Journal of Biological Chemistry, 293 (44), pp. 16964-16983. 2018
- One-Pot Peptide Ligation-Oxidative Cyclization Protocol for the Preparation of Short-/Medium-Size Disulfide Cyclopeptides
Spengler, J., Blanco-Canosa, J.B., Forni, L., Albericio, F.
Org Lett, 20 (14), 4306-4309(2018).
- Molecular mechanism of Gαi activation by non-GPCR proteins with a Gα-Binding and Activating motif.
de Opakua AI, Parag-Sharma K, DiGiacomo V, Merino N, Leyme A, Marivin A, Villate M, Nguyen LT, de la Cruz-Morcillo MA, Blanco-Canosa JB, Ramachandran S, Baillie GS, Cerione RA, Blanco FJ, Garcia-Marcos M.
Nat Commun. 2017 May 18;8:15163.
- High Affinity Immobilization of Proteins Using the CrAsH/TC
Schulte-Zweckel, J.; Rosi, F.; Sreenu, D.; Schroder, H.; Niemeyer, C. M.; Triola, G.
Tag. Molecules, 21, 2016
- Semisynthetic lipidated LC3 protein mediates membrane fusion.
Yang A, Li Y, Pantoom S, Triola G, Wu YW.
Chembiochem. 14 1296-300, 2013
- Algar WR, Blanco-Canosa JB, Manthe RL, Susumu K, Stewart MH, Dawson PE, Medintz IL.
Synthesizing and modifying peptides for chemoselective ligation and assembly into quantum dot-peptide bioconjugates.
Methods Mol Biol. 2013;1025:47-73.
- Specific inhibition of GPCR-independent G protein signaling by a rationally engineered protein.
Leyme A, Marivin A, Maziarz M, DiGiacomo V, Papakonstantinou MP, Patel PP, Blanco-Canosa JB, Walawalkar IA, Rodriguez-Davila G, Dominguez I, Garcia-Marcos M.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Nov 28;114(48):E10319-E10328.
- Concurrent Modulation of Quantum Dot Photoluminescence Using a Combination of Charge Transfer and Förster Resonance Energy Transfer: Competitive Quenching and Multiplexed Biosensing Modality.
Algar WR, Khachatrian A, Melinger JS, Huston AL, Stewart MH, Susumu K, Blanco-Canosa JB, Oh E, Dawson PE, Medintz IL.
J Am Chem Soc. 2017 Jan 11;139(1):363-372.
- Squaramides with cytotoxic activity against human gastric carcinoma cells HGC-27: synthesis and mechanism of action.
Quintana, M. Alegre-Requena, J.V., Marqués-López, E., Herrera, R.P., Triola, G.
Med. Chem. Commun MedChemComm 7, 550-61, 2016
- Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (3rd edition).
Klionsky DJ, Abdelmohsen K, Abe A, Abedin MJ, Abeliovich H, Acevedo Arozena A, Adachi H, Adams CM, Adams PD et al.
Autophagy. 12 1-222, 2016
- Specificity of Lipoprotein Chaperones for the Characteristic Lipidated Structural Motifs of their Cognate Lipoproteins.
Mejuch T, van Hattum H, Triola G, Jaiswal M, Waldmann H.
Chembiochem. 16 2460-5, 2016
- Chemical tools for modulating autophagy.
Triola, G.
Tetrahedron 3 387–406, 2015
- Chemical Protein Synthesis Using a Second-Generation N-Acylurea Linker for the Preparation of Peptide-Thioester Precursors.
Blanco-Canosa JB, Nardone B, Albericio F, Dawson PE.
J Am Chem Soc. 2015 Jun 10;137(22):7197-209.
- Site-specific, reversible and fluorescent immobilization of proteins on CrAsH-modified surfaces for microarray analytics.
Schulte-Zweckel J, Rosi F, Sreenu D, Schröder H, Niemeyer CM, Triola G.
Chem Commun (Camb). 50 12761-4., 2014
- Structure Guided Design and Kinetic Analysis of Highly Potent Benzimidazole Inhibitors Targeting the PDEδ Prenyl Binding Site.
Zimmermann G, Schultz-Fademrecht C, Küchler P, Murarka S, Ismail S, Triola G, Nussbaumer P, Wittinghofer A, Waldmann H.
J Med Chem. 57 5435-48, 2014
- Interaction of the human N-Ras protein with lipid raft model membranes of varying degrees of complexity.
Vogel A, Nikolaus J, Weise K, Triola G, Waldmann H, Winter R, Herrmann A, Huster D.
Biol Chem. 2014, 395,779-89.
- Rotational and translational dynamics of ras proteins upon binding to model membrane systems.
Werkmüller A, Triola G, Waldmann H, Winter R.
Chemphyschem. 14 3698-705, 2013
- Synthesis of lipidated peptides.
Rosi F, Triola G.
Methods Mol Biol. 1047 161-89, 2013
